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虚拟筛选辅助揭示中药药效物质基础的思路与初(5)

时间:2025-05-12   来源:未知    
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中草药综述

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第42卷 第9期 2011年9月

100

a

-100

b

100

-100

c

100

-100 0.0 100

d

·1669·

100

-100 0.0 100 200 300

a-胰岛素受体 b-α-葡萄糖苷酶 c-碳酸酐酶XII d-盐皮质激素受体

a-insulin receptor b-α-glucosidase c-carbonic anhydrase XII d-mineralocorticoid receptor

图1 分子对接评分分布图

Fig. 1 MolDockScore distribution of docked results 表3 分子对接评分排序前28个分子(胰岛素受体靶点) Table 3 MolDockScore of first 28 molecules for insulin receptor target

排序

配 体

MolDockScore

排序

配 体

MolDockScore 142.934 142.553 142.249 141.918 141.404 141.116 140.512 140.194 139.785 136.936 136.602 135.863 134.372 133.337

1 albanin G 2 albafuran C 3 4 6

桑呋喃M(mulberrofuran M) 桑根酮G(sanggenone G) 桑呋喃 B

kuwanol B kuwanon I moracenin C 槲皮素-3-(6-丙二酰葡萄糖苷) 桑根酮T 桑呋喃S

kuwanon H 桑呋喃I 桑呋喃A 芦丁(rutin) moracenin D albafuran A kuwanon J alboctalol

5 kuwanon W 7 albanin F 8 kuwanon P 9 10 12

桑呋喃L 桑呋喃D 桑呋喃O

11 artonin I 13 moracenin A 14 kuwanon X

它们的评分与参考配体的对接评分较为相近(表5),这与活性实验数据[5-6]基本相符。另外,桑椹中的菊色素(chrysanthemin)和矢车菊素-3-芸香糖苷(cyanidin-3-rutinoside)亦能抑制α-葡萄糖苷酶[7-8],评分分别为 112.907、 94.582 3。文献数据[8]显示,矢车菊素-3-芸香糖苷和伏格列波糖对源于面包酵、母的α-葡萄糖苷酶的IC50分别为(19.70±0.24)(23.40±0.30)μmol/L,可见,活性实测值能够支持预测结果。

3.2.4 针对碳酸酐酶XII的虚拟筛选结果 靶点模型自带的参考配体乙酰唑胺(acetazolamide)的评分为 103.975。桑类中药化学成分中MolDockScore评分排序前50个分子见表6。

3.2.5 针对盐皮质激素受体的虚拟筛选结果 靶点模型自带的参考配体醛固酮(aldosterone)的评分为 160.697。桑类中药化学成分中,与盐皮质激素受体对接时分子对接评分绝对值大于醛固酮评分的90%的分子共14个,见表7。

3.2.6 讨论 以上虚拟筛选结果说明:(1)桑类中药中一些已知的α-葡萄糖苷酶抑制成分的预测结果与实际情况较为吻合,表明软件有很好的预测精度;(2)分别针对各靶点筛出的理论活性成分群可能在一定程度上较全面地反映了所研究功效的物质基础,值得进一步进行药理实验验证;(3)桑类中药治消渴证可能主要针对α-葡萄糖苷酶靶点,利尿可能主要针对碳酸酐酶XII靶点,这需要进一步扩大

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