虚拟筛选辅助揭示中药药效物质基础的思路与初(6)

中草药综述

·1670· 中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第42卷 第9期 2011年9月

表4 分子对接评分排序前50个分子（α-葡萄糖苷酶靶点） Table 4 MolDockScore of first 50 molecule-for α-glucosidase target

排序 2

配 体

桑呋喃M

MolDockScore 排序 配 体 MolDockScore 127.211 126.898 126.868 126.760 126.277 125.804 125.673 125.275 125.079 124.963 124.449 124.280 124.147 123.967 123.215 122.829 122.769 121.950 121.653 121.003 120.985 120.621 120.615 120.392 120.193

1 albanin F 3 albafuran C 4 artonin I 5 6 7

桑呋喃O 桑根酮E

碧冬茄素-3-芸香糖苷

桑呋喃V

4-prenylmoracin moracenin B moracenin D 桑根酮G

sophoraflavanone D kuwanon N albafuran B volaxanthin 桑呋喃A

四氢叶酸（folinic acid） kuwanon Y albanin D 桑呋喃S

桑根醇H（sanggenol H） kinuyutaka kenusanone C alboctalol 桑呋喃L

dimoracin kuwanon P kuwanon G ω-hydroxymoracin

咖啡酰矢车菊素-3-槐糖苷-5-葡萄糖 kuwanon M

表5 桑类中药的生物碱类α-葡萄糖苷酶抑制剂的预测评分

8 albanin G 9 kuwanon X 10 moracenin A 11 kuwanon W 12 13 15

桑根酮D 桑根酮T 桑呋喃B

14 chalcomoracin 16 albafuran A 17 albanin E 18 mulberrofuran I 19 21 22 24 25

芦丁 桑根酮P 桑呋喃N 桑呋喃H 桑呋喃R 20 nonaisoprenol

23 kuwanon Z

Table 5 Forecast score of some known alkaloids and α-glucosidase inhibitors in Chinese herb Sang 排序

配 体

MolDockScore 86.328 77.012 76.938 76.324 69.624 68.263 66.503 65.889

1 1, 4-dideoxy-1,4-imino-(2-O-β-D-glucopyranosyl)-D-arabinitol 2 4-O-α-D-galactopyranosyl-calystegine B2 3 4 5

2-O-α-D-吡喃半乳糖基-1-脱氧野尻霉素 1-脱氧野尻霉素

3-O-α-D-吡喃葡萄糖基-1-脱氧野尻霉素

6 calystegine B1 7 calystegine B2 8 fagomine

靶点筛选范围进行确证；（4）一些成分可能具有多靶点活性，如albanin G针对胰岛素受体、α-葡萄糖苷酶和碳酸酐酶XII 3个靶点的理论活性均强于相应的参考配体。 4 结语

4.1 所有对接软件的基本原理都是利用各种参数

对配体分子与靶点分子的相互作用进行模拟，从而给出相互作用的评分，根据评分预测配体的活性。这些参数包括电性参数、立体参数、疏水参数等。软件所采用的参数是建立在大量实验数据基础之上的。参数的运用及各种算法将决定对接软件的精度。MVD软件是近年发展起来的一种高精度对接软件，