虚拟筛选辅助揭示中药药效物质基础的思路与初(7)

中草药综述

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第42卷 第9期 2011年9月

表6 对接评分排序前50个分子（碳酸酐酶XII）

Table 6 MolDockScore of first 50 molecule for anhydrase XII target

排序

1 albanin F 2 桑呋喃D 3 moracenin D 4 桑呋喃B

5 异戊基腺苷（isopentenyl adenosine） 6 kuwanon P 7 桑根酮K 8 桑呋喃L 9 桑呋喃V 10 桑根醇D 11 kuwanon J 12 kuwanon M 13 4-prenylmoracin 14 kuwanon W 15 桑呋喃M

16 tetrahydrokuwanon C tetramethyl ether 17 叶酸（folic acid）

18 玉米素核苷（zeatin riboside） 19 菊色素（chrysanthemin） 20 苦参啶（kuraridin） 21 artonin I

22 矢车菊素-3-芸香糖苷 23 桑呋喃N 24 moracenin A 25 licorisoflavan A

配 体

MolDockScore

排序

moracin I albafuran C albanin G kuwanon X moracin H kuwanon C glutathione kuwanon S moracenin B chalcomoracin 桑呋喃I 桑根酮E

矢车菊素-3-O-β-吡喃葡萄糖苷 moracin A maclurin kuwanol D 桑根酮D kuwanon H

槲皮素-3-O-(6''-O-乙酰基)-β-D-吡喃葡萄糖苷 heterophyllin moracenin C moracin B broussochalcone A 桑根醇C compound B

配 体

·1671·

MolDockScore 123.690 123.435 122.811 122.638 122.025 121.888 121.682 120.877 119.933 119.696 118.893 118.710 118.027 117.739 117.672 117.072 116.769 116.343 116.312 116.013 115.909 115.791 115.459 115.458 115.432

表7 对接评分排序前14个分子（盐皮质激素受体）

Table 7 MolDockScore of first 14 molecule for mineralocorticoid receptor target

排序 1 2 4

桑呋喃D 桑根醇A 四氢叶酸

配 体

MolDockScore

排序

配 体

MolDockScore 149.169 148.799 147.349 147.176 146.308 146.175 145.236

albafuran A 桑呋喃A 桑根酮K

sophoraflavanone D albafuran B 玉米素核苷 albanin E

3 kinuyutaka 5 kuwanon U

6 6-geranylnorartocarpetin 7

桑呋喃B

在对接精度、效率方面优于经典的对接程序Glide、Surflex、Gold、FlexX等[9]。

4.2 与常规筛选方法不同，虚拟筛选无需预先准备化合物样品，只需知道化合物的确切结构，因此，

对于辅助评价中药中已确认结构的成分对各种靶点的活性是非常有用的[10-12]。虚拟筛选能够在较短时间内对数以万计的化合物进行多靶点筛选，因此也具有高通量的性质。